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一、毒化物、不溶物、金属离子和焦油，不包括低分子杂质、异构体和溶剂残留。都会影响反应速度，雷尼镍一般耐毒化能力较强，毒化主是针对钯碳。
毒化物主要硫磷化物，包括各种形式含用硫磷元素的物质。毒化物引入的途径包括原料、溶剂、反应釜和气体等；
不溶物主要是无机物和聚合物等，主要沉积在催化剂表面，使反应位点受阻，反应变慢；
金属离子主要重金属，铜离子、汞离子、铅离子和镉离子等，与催化剂反应，从而使反应变慢；
焦油的作用机理与不溶物相似，也可能是反应中产生的，所以反应条件一般不能太高，否则反应速度变慢；
杂质的因素很难通过仪器分析出来，须通过实验验证才能知道，这在催化氢化中易忽略。
二、搅拌催化剂的混合效果也会影响反应速度，因氢气在溶剂中溶解度较小，反应体系中多呈气态存在；原料溶解在溶剂中，为液态；催化剂为固态。
微观上看，反应发生在催化剂表面，良好的搅拌能使气态氢与原料在催化剂表面快速通过并发生反应，同时把产物带走。
实验室小试时多用磁力搅拌，因量小加上磁力有研磨催化剂的作用，一般反应快；中试时，推进式搅拌桨以下压式混合反应体系，效果较好。雷尼镍因较重，受搅拌效果影响的因素大；钯碳因钯金属吸附在活性炭上，相对影响较小；工业化生产时，规模大，搅拌效果较差，一般都比中试反应慢；
传统锚氏搅拌没有方向，双向均可正常搅拌，不影响反应速度；推进式搅拌桨有方向，正确的搅拌方向反应效果快，反向影响反应速度。